Воздействие этилмеркаптана на организм человека: даже в минимальной концентрации приводит к сильной боли в голове, тошноте и неукротимой рвоте. Значительная концентрация нарушает деятельность нервной системы, вызывая судорожный синдром, паралич, коллапс. Смерть наступает в результате остановки дыхания.
Предельно допустимая концентрация (ПДК) этилмеркаптана в воздухе рабочей зоны: 1 мг/м3.